Para esto usaré Ubuntu Server 6.06 LTS ya que tiene soporte hasta el 2011.
Primero, instalar Ubuntu Server. Como lo estoy haciendo bajo Parallels, descargué el disco Alternate (el disco server normal no sirve porque instala pero no bootea). Para instalar Server a partir de este disco hay que especificar "server" como opción de partida.

Contestar a las preguntas que hace el sistema sobre ubicación, zona horaria, etc. Mi hostname será "testubuntu." Por default este será el nombre del PDC después también.

El primer usuario tendrá permisos administrativos y será el único usuario que crearemos fuera de la infraestructura LDAP. Para seguir el tema Windows, pongámosle "Administrator" (aunque esto no es muy recomendable por seguridad, puede ser mejor usar un nombre cualquiera).

Recuerda ponerle un password fuerte a este usuario. Luego, a esperar que termine la instalación y reinicie el sistema.
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